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寧夏疾病預防控制中心首次開展新冠病例基因溯源檢測工作

訪問(wen)量: 69來源:本(ben)站(zhan)作者(zhe): 時間:2022-08-05分享:

  自2021年7月(yue)(yue)30日(ri)(ri)寧(ning)夏確(que)診外省輸入病(bing)(bing)(bing)(bing)例(li)張某某,7月(yue)(yue)31日(ri)(ri)22時采集(ji)到合格(ge)基因測(ce)(ce)序(xu)(xu)標本(ben),中(zhong)心(xin)(xin)領導立即部署(shu)深度測(ce)(ce)序(xu)(xu)工(gong)作(zuo),組(zu)(zu)(zu)織專業技術(shu)人(ren)員,日(ri)(ri)夜不停地開展測(ce)(ce)序(xu)(xu)工(gong)作(zuo),通過文庫制備、簇生成(cheng)、上機(ji)測(ce)(ce)序(xu)(xu)與數(shu)據比(bi)對(dui)分析,最終在36小時后,于(yu)8月(yue)(yue)2日(ri)(ri)完成(cheng)該病(bing)(bing)(bing)(bing)例(li)全基因組(zu)(zu)(zu)測(ce)(ce)序(xu)(xu),確(que)定該標本(ben)為德爾塔毒(du)株。通過與國家疾控(kong)中(zhong)心(xin)(xin)的(de)數(shu)據庫比(bi)對(dui),該病(bing)(bing)(bing)(bing)例(li)基因組(zu)(zu)(zu)序(xu)(xu)列和江(jiang)蘇省7月(yue)(yue)24日(ri)(ri)以(yi)來報送本(ben)土(tu)病(bing)(bing)(bing)(bing)例(li)新冠病(bing)(bing)(bing)(bing)毒(du)基因組(zu)(zu)(zu)完全一致,共(gong)享全部突變(bian)位點,高度同源。此次基因組(zu)(zu)(zu)測(ce)(ce)序(xu)(xu)工(gong)作(zuo)的(de)完成(cheng),標志著寧(ning)夏疾病(bing)(bing)(bing)(bing)預防控(kong)制中(zhong)心(xin)(xin)已具備新冠病(bing)(bing)(bing)(bing)毒(du)基因組(zu)(zu)(zu)高通量二代測(ce)(ce)序(xu)(xu)能力,可為寧(ning)夏新型冠狀病(bing)(bing)(bing)(bing)毒(du)疫情以(yi)及其他傳染病(bing)(bing)(bing)(bing)病(bing)(bing)(bing)(bing)原體的(de)鑒定和溯源、防控(kong)應對(dui)提供技術(shu)支撐。
  基(ji)因(yin)組(zu)測序(xu)可在(zai)第一時間獲(huo)取新(xin)發未(wei)知病(bing)(bing)毒的(de)(de)(de)基(ji)因(yin)組(zu)序(xu)列(lie)(lie)(lie)信息,已成為(wei)(wei)研究疾病(bing)(bing)暴發的(de)(de)(de)重要工具。通(tong)過構建進化樹,研究不(bu)同(tong)患者病(bing)(bing)毒遺傳(chuan)序(xu)列(lie)(lie)(lie)變(bian)化,能在(zai)分(fen)子(zi)生(sheng)物學(xue)層面揭示病(bing)(bing)毒的(de)(de)(de)傳(chuan)播方式,分(fen)析新(xin)冠(guan)病(bing)(bing)毒的(de)(de)(de)進化來源,研究新(xin)冠(guan)病(bing)(bing)毒的(de)(de)(de)致病(bing)(bing)病(bing)(bing)理機制(zhi),為(wei)(wei)控制(zhi)疫(yi)情暴發提供科(ke)學(xue)依據(ju)。通(tong)過檢測新(xin)冠(guan)病(bing)(bing)毒的(de)(de)(de)全基(ji)因(yin)組(zu)序(xu)列(lie)(lie)(lie),再將這(zhe)(zhe)個序(xu)列(lie)(lie)(lie)通(tong)過算法(fa)與(yu)數(shu)據(ju)庫中的(de)(de)(de)數(shu)據(ju)進行(xing)比對,可以初步判斷(duan)其地域(yu)來源。將序(xu)列(lie)(lie)(lie)與(yu)既往病(bing)(bing)例序(xu)列(lie)(lie)(lie)進行(xing)比對,如果序(xu)列(lie)(lie)(lie)在(zai)同(tong)一進化樹分(fen)支上,則可以判斷(duan)這(zhe)(zhe)些病(bing)(bing)例是(shi)否(fou)來自同(tong)一傳(chuan)播鏈或傳(chuan)染(ran)源。
  此次疫情病原(yuan)體為德(de)爾(er)塔變(bian)(bian)異株(zhu)(zhu),德(de)爾(er)塔變(bian)(bian)異株(zhu)(zhu)與其他(ta)變(bian)(bian)異株(zhu)(zhu)相比(bi),在(zai)S蛋(dan)白上新增了“L452R”、“T478K”和“P681R”3個重要突(tu)變(bian)(bian)。這些突(tu)變(bian)(bian)導致病毒具(ju)有(you)傳播力(li)強、潛伏期短、病毒載量高、病程(cheng)進展快等特(te)點。在(zai)此提醒廣大群眾,減少(shao)聚集,保持(chi)社交距(ju)離,防止疫情擴散(san)。

 

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