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寧夏疾病預防控制中心首次開展新冠病例基因溯源檢測工作

訪問量: 69來源:本站作者: 時間:2022-08-05分享:

  自2021年7月(yue)30日寧夏(xia)確診外省輸入病(bing)(bing)(bing)例(li)(li)張(zhang)某(mou)某(mou),7月(yue)31日22時采(cai)集到合格基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)測(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)標(biao)(biao)(biao)本,中(zhong)(zhong)心(xin)領導立即部署深度測(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)工(gong)作,組織專業技術(shu)人員(yuan),日夜(ye)不停地開展測(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)工(gong)作,通(tong)過文庫制備、簇(cu)生成、上(shang)機測(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)與數(shu)據比(bi)對(dui)分(fen)析,最(zui)終在36小時后(hou),于8月(yue)2日完(wan)(wan)(wan)成該(gai)(gai)病(bing)(bing)(bing)例(li)(li)全基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)組測(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu),確定(ding)該(gai)(gai)標(biao)(biao)(biao)本為德爾塔毒株。通(tong)過與國家疾控(kong)中(zhong)(zhong)心(xin)的數(shu)據庫比(bi)對(dui),該(gai)(gai)病(bing)(bing)(bing)例(li)(li)基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)組序(xu)(xu)(xu)(xu)列和江蘇省7月(yue)24日以(yi)來報送本土病(bing)(bing)(bing)例(li)(li)新冠(guan)病(bing)(bing)(bing)毒基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)組完(wan)(wan)(wan)全一致,共(gong)享(xiang)全部突變位點(dian),高(gao)度同源。此次(ci)基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)組測(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)工(gong)作的完(wan)(wan)(wan)成,標(biao)(biao)(biao)志(zhi)著寧夏(xia)疾病(bing)(bing)(bing)預防控(kong)制中(zhong)(zhong)心(xin)已具備新冠(guan)病(bing)(bing)(bing)毒基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)組高(gao)通(tong)量二代測(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)能力,可(ke)為寧夏(xia)新型冠(guan)狀病(bing)(bing)(bing)毒疫情以(yi)及其他傳染病(bing)(bing)(bing)病(bing)(bing)(bing)原體的鑒定(ding)和溯源、防控(kong)應對(dui)提供技術(shu)支撐。
  基因(yin)組測序(xu)可在第一時(shi)間獲取新(xin)發未(wei)知(zhi)病(bing)(bing)毒(du)(du)的基因(yin)組序(xu)列(lie)(lie)信息,已成(cheng)為研究疾病(bing)(bing)暴發的重要工具。通(tong)過構建進(jin)化(hua)(hua)樹,研究不同(tong)患者病(bing)(bing)毒(du)(du)遺傳序(xu)列(lie)(lie)變化(hua)(hua),能在分子生物(wu)學層面揭(jie)示病(bing)(bing)毒(du)(du)的傳播方式,分析(xi)新(xin)冠病(bing)(bing)毒(du)(du)的進(jin)化(hua)(hua)來源,研究新(xin)冠病(bing)(bing)毒(du)(du)的致病(bing)(bing)病(bing)(bing)理機制(zhi),為控制(zhi)疫(yi)情暴發提供科學依據(ju)。通(tong)過檢(jian)測新(xin)冠病(bing)(bing)毒(du)(du)的全基因(yin)組序(xu)列(lie)(lie),再將這(zhe)個序(xu)列(lie)(lie)通(tong)過算法與數(shu)據(ju)庫中的數(shu)據(ju)進(jin)行(xing)比對(dui),可以初步判(pan)(pan)斷(duan)其地(di)域來源。將序(xu)列(lie)(lie)與既往病(bing)(bing)例序(xu)列(lie)(lie)進(jin)行(xing)比對(dui),如果序(xu)列(lie)(lie)在同(tong)一進(jin)化(hua)(hua)樹分支上,則(ze)可以判(pan)(pan)斷(duan)這(zhe)些病(bing)(bing)例是(shi)否來自同(tong)一傳播鏈或傳染源。
  此(ci)次疫情病(bing)(bing)原體(ti)為德爾(er)塔變異(yi)(yi)株,德爾(er)塔變異(yi)(yi)株與其(qi)他變異(yi)(yi)株相比,在S蛋白上(shang)新(xin)增了“L452R”、“T478K”和“P681R”3個重要突變。這些突變導(dao)致病(bing)(bing)毒(du)具(ju)有傳播力強、潛伏(fu)期短、病(bing)(bing)毒(du)載(zai)量高、病(bing)(bing)程進展快(kuai)等特點。在此(ci)提醒廣大群眾,減少(shao)聚集,保持社交距(ju)離,防止疫情擴散。

 

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