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寧夏疾病預防控制中心首次開展新冠病例基因溯源檢測工作

訪問(wen)量: 69來源(yuan):本站作者(zhe): 時(shi)間:2022-08-05分享:

  自(zi)2021年7月(yue)30日(ri)寧夏(xia)確診(zhen)外省輸入病(bing)(bing)(bing)例(li)(li)張(zhang)某(mou)某(mou),7月(yue)31日(ri)22時(shi)采集到合格(ge)基(ji)因測(ce)(ce)序標(biao)本,中(zhong)心(xin)領導立即(ji)部署深度測(ce)(ce)序工作,組(zu)(zu)織(zhi)專業(ye)技術人員,日(ri)夜不停地開展(zhan)測(ce)(ce)序工作,通(tong)過文(wen)庫制備、簇生成(cheng)、上機測(ce)(ce)序與(yu)數據比對(dui)分析,最終在(zai)36小時(shi)后,于8月(yue)2日(ri)完(wan)成(cheng)該(gai)病(bing)(bing)(bing)例(li)(li)全(quan)基(ji)因組(zu)(zu)測(ce)(ce)序,確定該(gai)標(biao)本為(wei)德爾(er)塔毒(du)株。通(tong)過與(yu)國(guo)家(jia)疾(ji)控(kong)中(zhong)心(xin)的(de)數據庫比對(dui),該(gai)病(bing)(bing)(bing)例(li)(li)基(ji)因組(zu)(zu)序列和(he)江(jiang)蘇省7月(yue)24日(ri)以(yi)來報送本土病(bing)(bing)(bing)例(li)(li)新(xin)冠病(bing)(bing)(bing)毒(du)基(ji)因組(zu)(zu)完(wan)全(quan)一(yi)致,共享(xiang)全(quan)部突變位點,高(gao)度同源。此次基(ji)因組(zu)(zu)測(ce)(ce)序工作的(de)完(wan)成(cheng),標(biao)志著寧夏(xia)疾(ji)病(bing)(bing)(bing)預防(fang)控(kong)制中(zhong)心(xin)已具備新(xin)冠病(bing)(bing)(bing)毒(du)基(ji)因組(zu)(zu)高(gao)通(tong)量二代測(ce)(ce)序能力,可為(wei)寧夏(xia)新(xin)型冠狀(zhuang)病(bing)(bing)(bing)毒(du)疫情以(yi)及其他傳(chuan)染(ran)病(bing)(bing)(bing)病(bing)(bing)(bing)原體的(de)鑒定和(he)溯源、防(fang)控(kong)應對(dui)提供技術支撐。
  基因(yin)組(zu)測序(xu)(xu)可在第一(yi)時間(jian)獲取新發未知病(bing)(bing)(bing)毒的(de)基因(yin)組(zu)序(xu)(xu)列(lie)(lie)(lie)信息,已成為(wei)研(yan)究疾(ji)病(bing)(bing)(bing)暴(bao)發的(de)重要工具。通過(guo)(guo)構建進(jin)(jin)(jin)化樹,研(yan)究不同(tong)患者(zhe)病(bing)(bing)(bing)毒遺傳序(xu)(xu)列(lie)(lie)(lie)變化,能在分(fen)子生物學層(ceng)面(mian)揭(jie)示(shi)病(bing)(bing)(bing)毒的(de)傳播(bo)方式,分(fen)析(xi)新冠病(bing)(bing)(bing)毒的(de)進(jin)(jin)(jin)化來源,研(yan)究新冠病(bing)(bing)(bing)毒的(de)致病(bing)(bing)(bing)病(bing)(bing)(bing)理機制(zhi),為(wei)控制(zhi)疫情(qing)暴(bao)發提供科學依據(ju)。通過(guo)(guo)檢測新冠病(bing)(bing)(bing)毒的(de)全基因(yin)組(zu)序(xu)(xu)列(lie)(lie)(lie),再將這個序(xu)(xu)列(lie)(lie)(lie)通過(guo)(guo)算法與(yu)數據(ju)庫中的(de)數據(ju)進(jin)(jin)(jin)行比(bi)對,可以(yi)初步判斷(duan)其地(di)域來源。將序(xu)(xu)列(lie)(lie)(lie)與(yu)既往(wang)病(bing)(bing)(bing)例(li)序(xu)(xu)列(lie)(lie)(lie)進(jin)(jin)(jin)行比(bi)對,如果序(xu)(xu)列(lie)(lie)(lie)在同(tong)一(yi)進(jin)(jin)(jin)化樹分(fen)支上,則可以(yi)判斷(duan)這些病(bing)(bing)(bing)例(li)是否(fou)來自同(tong)一(yi)傳播(bo)鏈(lian)或傳染(ran)源。
  此(ci)次疫情病原體為德爾(er)塔變異(yi)株,德爾(er)塔變異(yi)株與其他變異(yi)株相比(bi),在S蛋(dan)白(bai)上新增(zeng)了“L452R”、“T478K”和“P681R”3個重要(yao)突變。這些突變導致病毒具有傳播力強、潛(qian)伏期短、病毒載(zai)量高、病程進展(zhan)快等特點。在此(ci)提(ti)醒廣大群眾,減少聚集,保持社交距離,防(fang)止疫情擴散。

 

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